Jezioro to leży na Pojezierzu Wschodniosuwalskim. Jest to najgłębsze jezioro w Polsce o głębokości ponad stu metrów. Jest to swoiste jezioro polodowcowe o niskiej trofii, czyli oligo-mezotroficzne. Na brzegach znaleźć można liczne głazy o nawet kilkumetrowej szerokości. Wody Hańczy są niezwykle czyste, a ich przezroczystość sięga nawet dwunastu metrów. Dno jest dosyć piaszczyste i żwirowe. Roślinność jest słabo rozwinięta, jednakże nie brakuje tam fauny jeziornej, głównie ryb i ptaków. Linia brzegowa jest średnio rozwinięta z niezwykle malowniczymi zatokami.
